rindai87@ハチロク世代

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2008-03-04

あるバイオインフォマティシャンの苦悩

00:18

バイオインフォマティクスと言えば聞こえはよろしいが、実態はなかなか悲惨なんすよ。


ちまたにあふれるバイオインフォマティシャンは、ほとんが本業が生物屋さん。

僕は本業が情報のバイオインフォマティシャン。

情報系のBIさんは、自分で言うのもなんやけど、けっこうレアなわけだ。

で、ここで問題なのは、学んでいくルートのようなものが確立されていないこと。

ちまたにあふれる書籍も、自分で確かめた限りほぼ全てが生物系のBIさん向けのもの。

たまにある情報系のものでも、かなり生物の知識が要求されているように感じる。


以上が世間一般のBI事情。

この時点ですでに情報系BIさんはかなり出発で苦しむ分けですが…

続いて、大学及び研究室での現状。


今のところ我が大学では情報系のBIさんは僕一人。

なぜって?

立ち上げの研究だから。

そう、指導教官すらいない、と。

ヤバスですね~。

先生に質問できないわけですよ。


あ、忘れてた。

大学にはもう一人の情報系BIがいます。

マレーシアからの留学生orz

東南アジアでは情報系のBIが割りと盛んらしいよ。


で、最初研究をどうすればいいか分からなかったので、とりあえずその人の研究を追ったわけです。

それが発現量データとGASVMとNew-GASVM。

後で分かったことながら、この組み合わせは非常に難解。

発現量データは、高次元でサンプル数が少ない「次元の呪い」のデータなのだ。

さらに自分の英語の拙さを差っぴいても、どうもアルゴリズムむずし、何回留学生に聞いても分からんとか思ってたら、留学生マレーシア工科大学で教鞭を振るってたらしい。

初心者向けの研究じゃねぇorz


けど、何とかがんばって先週の卒研発表には臨めたわけですよ。

ただし、結果は散々だった。

恐らく発表内容を誰にも理解してもらえずorz

的外れな質問乱発+わけのわからんダメだしを食らったわけですよ。

たまらん><


たぶん生物側で発表しても、裏づけがない、とか言って袋叩きにあうんだろうなぁ…


終わったことはいいとして修論が今から心配だ。


あと、学会のセクションにそれらしいのがないので、「その他」っぽいセクションにねじ込まれるという迫害も受ける。

結論:情報系のBIは情報側からも生物側からも迫害を受けている!解放運動が必要だ!


ふぅ~、今年一年の不満を吐き出してしまったぜ。

HashHash2008/03/04 20:39遺伝子発現解析アルゴリズムの改善?
友達になってくだしあ><


↓学会用のアブストを堂々とブログで開示する奴もいるから大丈夫ですよ
http://d.hatena.ne.jp/Hash/20071130/1196433305

mishomisho2008/03/04 20:45あう……発現の部分は全くの門外漢なのです。SOMで解析できるのかぁー。

rindai87rindai872008/03/04 20:46>Hash

飯を食べたら和文も公開しようかな。
あと、敬語じゃなくてもいいよ~
というか、こっちが敬語疲れしてきただけやけどね(笑)

rindai87rindai872008/03/04 20:53>misho
実は僕も門外漢なのです。
ちょっとこの変の悲しすぎるストーリーでもエントリにしてみるか。

同情するならバイオインフォマティクスの知識をくれ><、みたいな。

rindai87rindai872008/03/04 20:54>wakataka_423
wwwよく分かってないことが分かったwww

なんか面白くなってきたからアブストの和訳とmishoへのコメントで書いたストーリーを後で書きませう。

wakataka_423wakataka_4232008/03/04 20:59「ロイシンジッパー型ペプチドの疎水面に」までは分かった。
自分は臨床検査医学から分子生物学の入り口までやってまつ

>rindai87
分かられてしまったwwww
SVMも初めて聞いた! もちょっと勉強せないけませんね。

HashHash2008/03/04 21:22BI熱すぎワロタ ww syou6162がついったで嫉妬している。

ちょっと後で卒研テーマを日記に上げてみるなどする。

mishomisho2008/03/05 00:40「水晶発振子マイクロバランス法」以外は分かった。
なんかもうハチロク世代の掲示板に生物情報科学とぴ作っちゃおうぜ。とけしかけてみるテスト。

rindai87rindai872008/03/05 00:45>misho
いっちゃうか~。
みんな乗ってきてくるんかよ。

暴走キャラというタグ付けはごめんでつ。

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